因为大脑发热，发生了关系，现在女孩怀孕了，

男孩是否犯罪需看女孩年龄。依据《刑法》，若女孩14周岁以上且自愿，则男孩不犯法；若未满14周岁，无论是否自愿，男孩均犯法。不及时处理可能导致更严重的法律后果。
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处理方式需视情况而定。若女孩14周岁以上且双方自愿，可协商处理后续事宜；若未满14周岁，男孩应尽快自首并承担法律责任。选择处理方式时，务必考虑女孩年龄及双方意愿。
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视年龄而定。若女孩14岁以上且自愿：1.双方协商处理怀孕事宜，如是否保留孩子等；2.寻求家长或专业人士帮助，确保决定合法且负责任。若女孩未满14岁：1.男孩应立即向警方自首；2.配合调查，承担相应法律责任；3.双方家庭需积极沟通，协商赔偿及后续安排。